Flodnejonögat (Lampetra fluviatilis) upptogs på den svenska rödlistan över hotade arter 2005. Därför genomförde Länsstyrelsen i Jönköpings län inventeringar av Vätterns tillflöden under 2006, 2007, 2009 och 2011. Förutom i vilka Vätterbäckar lekande flodnejonöga förekommer, ville man belägga vilka bäckar som är viktigast ur reproduktionshänseende, när lekvandringen äger rum och om det finns individer som vandrar upp redan under hösten. Dessutom ville man klargöra vilken typ av vandringshinder som är definitiva för flodnejonögats vandring uppströms. År 2010 gjordes en ny bedömning av det svenska beståndet av flodnejonöga, som nu anses vara livskraftigt och arten är inte längre rödlistad.