Styrelsen ansvarar inför medlemmarna (vid förbundsstämman) för förbundets verksamhet. Styrelsen företräder medlemmarnas intressen i föreningens syfte. I huvudsak innefattar det att förvalta föreningens tillgångar, ansvara för budget, genomföra arbetsprogram och bistå medlemmar och allmänhet med faktaunderlag till en gemensam grund för miljötillstånd och miljöpåverkan i Vättern. Ledamöter och ersättare utses bland medlemmar i förbundet och väljs på ordinarie föreningsstämma.
Ordförande
Ordförande i förbundet är Ann Holmlid, länsråd i Östergötlands län. Vice-ordförande är Anders Hedeborg, Vadstena kommun.
Ledamöter

Möten
Styrelsemöten hålls två gånger per år, under våren och hösten.
Mötesdatum för 2023:
- 12 april (Hotell Bellevue, Hjo)
- 12 oktober (Länsstyrelsen, Jönköping)