Från och med 1996 infördes provtagning av växtplankton redan i april då kiselalger förväntas ha en utvecklingstopp. Någon vårtopp i april har dock ännu inte kunnat påvisas utan liksom tidigare år uppmättes de högsta växtplanktonvolymerna under sommarmånaderna. Både djurplankton och djupbottenfaunan i Vättern kännetecknas av stabil artsammansättning. Mellanårsvariationen i biomassa är dock betydande för djupbottenfaunan p.g.a. varierande födotillgång (främst kiselalger).